耶鲁大学开设了14所学院，系院和学科划分细致。学院与学院之间关系融洽，相互合作，学生可以获得多所学院共同授予的联合学位。学校注重小班教学，致力于为社会培养不同领域的专业领导型人才。耶鲁大学主要分为耶鲁学院、人文与科学研究院以及各类专业学院。
耶鲁学院
耶鲁学院（Yale College）是一所文科学院，成立于1701年。旨在培养学生的求知欲、领导力和独立思考的能力。该学院有丰富的博物馆馆藏，并开设了积极活跃的表演艺术组织。
工程与应用科学学院
工程与应用科学学院（School of Engineering & Applied Science）成立于1852年，提供了本科以及硕士学位的教学和研究，主要设置了6个部门：生物医学工程、化学与环境工程、计算机科学、电气工程、机械工程与材料科学、应用物理。
法学院
耶鲁法学院（Law School）是知名的法学院之一，成立于1955年。学院拥有知名的教师，以小班制教学，为学生提供了丰富的机会。学院授予学生JD、LL.M.、JSD、Ph.D以及其他联合学位。学院具有高度的包容性，欢迎来自世界的学者。学生可以积极的参与国际、宪法和公司法律问题的主题活动，提高自身能力。
医学院
耶鲁医学院（School Of Medicine）成立于1810年，为学生提供了高质量的医学研究和患者护理。学院为学生提供了卓越的医疗中心，教育和激励学者学习医学知识。
